76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1147 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  472  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  95.04 
 
 		 242 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  93.42 
 
 		 243 aa  420  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  45.13 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  40.4 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  36.44 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 291 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  36.4 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.06 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  34.54 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  34.96 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.52 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.23 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  38.56 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.84 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.28 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  29.68 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.84 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  35.77 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.96 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  28.22 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  32.44 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.73 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.3 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  31.74 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  29.06 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  32 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.11 
 
 		 526 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.4 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.17 
 
 		 442 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 431 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  38.38 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.45 
 
 		 321 aa  85.9  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  30.28 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.8 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  36.36 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.22 
 
 		 425 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  30.6 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  34.91 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  30.43 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.62 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.69 
 
 		 430 aa  75.1  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  30.56 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  30.04 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  35.04 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.09 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.77 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  26.4 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  26.5 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  39.87 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  39.92 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.19 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  32.74 
 
 		 458 aa  68.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.28 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  26.58 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.82 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.43 
 
 		 448 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.01 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  34.04 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  24.26 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  35.15 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.11 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  31.65 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.61 
 
 		 448 aa  52  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.81 
 
 		 455 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  32.81 
 
 		 455 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.83 
 
 		 375 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.33 
 
 		 471 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  26.29 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>