113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3715 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3715  nitroreductase  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0995943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  30.05 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  31.37 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  31.25 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  30.88 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 215 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  30.77 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  30.39 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.3 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  25 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.96 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  27.8 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.84 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  25.47 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.48 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  32.81 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.93 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  29.17 
 
 		 458 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.05 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.6 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.6 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  23.62 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28 
 
 		 334 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  28.36 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  30.14 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.9 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  25.23 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  27.41 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  27.41 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.08 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  29.57 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  26.34 
 
 		 446 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.25 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.23 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  24.54 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  26.34 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.7 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.5 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  28.04 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  27.19 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.24 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1328  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.24 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  24.77 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.04 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  29.74 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.36 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  28.42 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  23.62 
 
 		 180 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  26.29 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  28.89 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  29.38 
 
 		 223 aa  48.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  27.17 
 
 		 450 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.67 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  41.51 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  27.27 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  29.9 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1022  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.6 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  0.22083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  23.96 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.91 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  47.92 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 		 982 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  25.97 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  22.12 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  25.81 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  26.51 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.12 
 
 		 170 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  27.05 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  28.37 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  26.87 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  23.44 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  42.86 
 
 		 275 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  29.65 
 
 		 461 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  27.27 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  25.25 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  22.17 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.04 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  26.7 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.53 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.75 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  27.45 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  27.75 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  21.99 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  25.74 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  29.23 
 
 		 448 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  28.34 
 
 		 350 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.17 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  22.04 
 
 		 275 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  24.17 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  40 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  42 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.95 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  42 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  27.54 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.02 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  23.38 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.22 
 
 		 221 aa  42  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>