289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0345 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  85.14 
 
 		 224 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  59.46 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  56.5 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  57.01 
 
 		 235 aa  258  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  56.28 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  54.87 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  55.86 
 
 		 233 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  54.26 
 
 		 229 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  58.77 
 
 		 239 aa  238  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  53.36 
 
 		 229 aa  237  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  54.75 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  54.3 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  54.3 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  53.74 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  54.3 
 
 		 242 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  49.77 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  51.53 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  52.25 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  52.65 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  51.35 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  50.23 
 
 		 247 aa  222  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  51.3 
 
 		 254 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  50.88 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  50.88 
 
 		 254 aa  221  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  52.25 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  49.56 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  50.46 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  49.56 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  50.92 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  48.9 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  46.82 
 
 		 229 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  48.66 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  47.14 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  43.81 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  39.27 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  42.59 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  48.15 
 
 		 228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  40.54 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  43.12 
 
 		 226 aa  174  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  40.62 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  41.52 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  38.68 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  39.29 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  38.91 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  42.04 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  41.18 
 
 		 219 aa  147  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  37.84 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  40.72 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  41.15 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  36.57 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  39.37 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  38.12 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  39.91 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  37.56 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  38.68 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  35.59 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  32.39 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  34.55 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  35.45 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  37.69 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  37.69 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  38.38 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  36.45 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  37.19 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  36.55 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  34.55 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  30.33 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  37.56 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  40.28 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  33.96 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  33.33 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  33.33 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  33.77 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  32.89 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  32.57 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  30.43 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  32.76 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  35.9 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  31.22 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  32.89 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  30.37 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  30.66 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  32.35 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  29.74 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  30.22 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  28 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  29.76 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28.1 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  31.43 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.29 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  27.49 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  36.36 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  50 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  25.46 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.43 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  23 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  23 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  25.46 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.93 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>