More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2325 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  100 
 
 		 234 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  90.22 
 
 		 225 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  87.5 
 
 		 225 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  90.18 
 
 		 225 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  81.53 
 
 		 227 aa  374  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  73.54 
 
 		 229 aa  330  8e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  50.22 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  45.58 
 
 		 224 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  36.64 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  33.33 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  33.79 
 
 		 232 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  31.96 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  34.51 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  34.51 
 
 		 235 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  34.63 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  32.08 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.73 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  36.36 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  36.24 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  36.36 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  33.49 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  31.6 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  32.89 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  32.89 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  31.3 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  29.41 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  31.98 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  32.86 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  30.87 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  27.8 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  31.56 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  31.56 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  32.59 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  32 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  31.53 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  29.68 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  31.34 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  31.11 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  32.44 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  30.84 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  34.27 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  32.11 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  29.91 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  31.42 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  29.46 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  30.63 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  31.11 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  31.11 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  31.02 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  28.82 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  29.22 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  31.14 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  34.27 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  31.11 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  28.31 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  28.7 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  29.02 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  29.02 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  28.25 
 
 		 225 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  28.57 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  28.57 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  30.67 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  36.23 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  28.25 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  26.67 
 
 		 223 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  28.9 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  29 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  27.68 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  29.2 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  26.89 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  28.12 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  26.13 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  28.82 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.11 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  26.99 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  28.26 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  26.7 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  31.03 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  25.78 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  28.5 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  26.01 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  26.34 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  25.91 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  26.7 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  29.41 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  25.56 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.83 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.86 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.71 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  45.21 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.6 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.73 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  27.15 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.24 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  27.75 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  28.04 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.92 
 
 		 334 aa  62  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  59.57 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.08 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  27.8 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>