270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2413 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  60.07 
 
 		 274 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  61.54 
 
 		 274 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  41.39 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  39.93 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  40.29 
 
 		 275 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  36.88 
 
 		 274 aa  188  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  37.96 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  35.9 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  37.45 
 
 		 284 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  36.86 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  37.36 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  37.91 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  32.73 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  36.23 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  33.21 
 
 		 274 aa  165  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  36.59 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  37.96 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  35 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  34.17 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  34.28 
 
 		 278 aa  159  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  30.55 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  30.37 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  29.67 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  30.48 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  29.15 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.88 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  31 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  28.95 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  29.96 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  26.71 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  24.91 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  29.89 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.61 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  24.11 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  24.47 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  25.61 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.68 
 
 		 334 aa  85.5  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.66 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  27.94 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.49 
 
 		 190 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.19 
 
 		 187 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  24.91 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.57 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  22.87 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.12 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  22.65 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.03 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  22.46 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.22 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  27.37 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  26.98 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.14 
 
 		 172 aa  61.6  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.81 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  22.01 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.79 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.79 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.17 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.61 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.63 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.01 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.6 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.51 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  22.75 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  33.81 
 
 		 172 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.58 
 
 		 170 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.27 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  25.71 
 
 		 174 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.86 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.06 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.8 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  27.27 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.93 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.32 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.77 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.31 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.47 
 
 		 174 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.68 
 
 		 176 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.01 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  31.65 
 
 		 172 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3432  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 982 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.368499  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  25.41 
 
 		 184 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.71 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  24.21 
 
 		 183 aa  52.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.06 
 
 		 170 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.4 
 
 		 184 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.86 
 
 		 178 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.74 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  24.74 
 
 		 170 aa  52  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  25.61 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  26.43 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.88 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.57 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  26.13 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  29.59 
 
 		 450 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  28.89 
 
 		 458 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  23.56 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  26.19 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.65 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>