More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2649 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2649  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1450  nitroreductase  54.97 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.761824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04940  Nitroreductase family protein  43.55 
 
 		 185 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680935  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3170  nitroreductase  43.01 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1600  nitroreductase  41.18 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  40.31 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  41.49 
 
 		 201 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  35.68 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  33.71 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  29.21 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4738  nitroreductase  32.32 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  32.46 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0644  nitroreductase  26.49 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0053  nitroreductase  31.67 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0831  nitroreductase family protein  28.04 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.046086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0679  nitroreductase family protein  28.04 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0928  nitroreductase family protein  26.98 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0679  nitroreductase  27.51 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  31.52 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0730  nitroreductase family protein  27.51 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0766  nitroreductase family protein  27.51 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.48 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0498  hypothetical protein  28.65 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.228432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12251  hypothetical protein  28.65 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  27.22 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0821  nitroreductase family protein  25.4 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4513  nitroreductase family protein  25.93 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  29.61 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  26.59 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  27.55 
 
 		 348 aa  67.8  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  27.53 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2213  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.27 
 
 		 227 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0138908  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.18 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4461  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.21 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.219812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2320  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 1580 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  27.78 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  30.54 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  28.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  28.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.03 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.41 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2717  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.35 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  27.23 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  29.94 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  27.93 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2763  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.72 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0692468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  29.31 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  29.26 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2554  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3403  nitroreductase  26.45 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.42 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  24.87 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25.65 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.57 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  30 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  29.58 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  30 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1643  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.26 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.462353  normal  0.0151841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1301  nitroreductase  30.16 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3754  nitroreductase  30.73 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  30.2 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  26.26 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  30 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2149  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.5 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  26.23 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  25.43 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  29.29 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2468  nitroreductase family protein  28.49 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.797111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.73 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.63 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  28.67 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  29.93 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2803  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.12 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662243 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  26.22 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  27.59 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3679  nitroreductase  27.04 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  27.03 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  25.71 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13071  hypothetical protein  24.54 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.212182  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  25.61 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1544  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.57 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233491  normal  0.110997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0603  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.29 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>