More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2995 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  100 
 
 		 271 aa  546  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  67.52 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  55.84 
 
 		 273 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  41.91 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  42.7 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  39.92 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  40.88 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  40.07 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  38.69 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  38.97 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  39.13 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  38.93 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  37.73 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  35.77 
 
 		 274 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  35.87 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  35.27 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  36.36 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  35.61 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  34.91 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  38.18 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  35.07 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  33.09 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  35.14 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  35.19 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  33.71 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  36.23 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  32.21 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  32.71 
 
 		 278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  35.32 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  33.07 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  29.85 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  31.48 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  28.37 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  27.24 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  30.45 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  30.6 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.99 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.16 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.64 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  29.45 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.39 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.92 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.23 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.71 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  27.11 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  29.94 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.53 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  25.13 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.23 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.44 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  24.87 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.68 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.06 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.88 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  24.08 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.75 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.83 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  25.81 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  25.81 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.23 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.09 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.47 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.26 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  28.57 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.42 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.59 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  23.53 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.82 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  29.44 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  26.7 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.74 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.52 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.64 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  25.41 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  27.62 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  29.55 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  24.21 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.35 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  26.67 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  28.19 
 
 		 221 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  25.14 
 
 		 184 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.93 
 
 		 178 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  23.28 
 
 		 175 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  24.21 
 
 		 189 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  23.65 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24 
 
 		 165 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  25.37 
 
 		 188 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  21.64 
 
 		 172 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  23.95 
 
 		 176 aa  52.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  25 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.27 
 
 		 184 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  23.53 
 
 		 189 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25 
 
 		 178 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  21.67 
 
 		 173 aa  52.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  26.49 
 
 		 185 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.14 
 
 		 186 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  27.06 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.17 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  26.56 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>