152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0390 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  100 
 
 		 274 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  39.42 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  38.27 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  34.06 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  35.38 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  36.59 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  33.45 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  33.45 
 
 		 272 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  35.48 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  34.41 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  33.46 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  32.73 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  34.17 
 
 		 263 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  31.91 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  32.25 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  31.16 
 
 		 273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  32.14 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  34.42 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  32.97 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  35.14 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  32.26 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  32.12 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  29.86 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  29.86 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  28.62 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  29.35 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  32.06 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  29.89 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  28.46 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.46 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  29.43 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  29.39 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  26.48 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  30.43 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.52 
 
 		 334 aa  95.5  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.92 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  29.37 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.59 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  30.8 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  27.68 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  21.95 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  23.39 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.7 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  31.84 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.6 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.47 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  27.04 
 
 		 184 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  23.53 
 
 		 188 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.2 
 
 		 187 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.23 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.38 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  25.99 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  25.71 
 
 		 172 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  22.87 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.19 
 
 		 181 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  23.81 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  23.61 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.31 
 
 		 175 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  22.96 
 
 		 215 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.24 
 
 		 178 aa  52.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  26.6 
 
 		 175 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.72 
 
 		 185 aa  52.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.57 
 
 		 165 aa  52.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.74 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.49 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.67 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.4 
 
 		 168 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.84 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  24.86 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.16 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.14 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  22.92 
 
 		 185 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  25 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  24.87 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  21.86 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  24.44 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.93 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  22.17 
 
 		 215 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  21.89 
 
 		 171 aa  48.9  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  23.78 
 
 		 178 aa  48.9  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  22.17 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.88 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  22.17 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  22.17 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3775  ferredoxin I  41.07 
 
 		 62 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  22.17 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.4 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  22.17 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  27.87 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  26.06 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  21.9 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  28.03 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  24.87 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  26.63 
 
 		 184 aa  46.6  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.42 
 
 		 190 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  37.04 
 
 		 180 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.12 
 
 		 194 aa  46.6  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  28.16 
 
 		 171 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  21.7 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>