More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1484 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  100 
 
 		 295 aa  614  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  42.91 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  35.84 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  36.92 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  37.41 
 
 		 263 aa  165  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  36.59 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  36.03 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  34.17 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  34.67 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  35.34 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  35.29 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  32.97 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  35 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  34.53 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  34.64 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  32.97 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  34.43 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  36.07 
 
 		 262 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  30.58 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  34.75 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  30.29 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  31.23 
 
 		 274 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  35.19 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  30.94 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  29.09 
 
 		 277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  32.08 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  33.82 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  33.8 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  28.21 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  28.72 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  30.48 
 
 		 278 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  28.36 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  29.32 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  29.35 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  28.67 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  28.26 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  25.55 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  28.68 
 
 		 263 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.7 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  27.8 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.51 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.85 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.46 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.32 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  26.28 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.57 
 
 		 178 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  24 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.7 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.08 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.63 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.29 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.29 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.23 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  23.12 
 
 		 163 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.78 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.23 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  24.72 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.86 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  25.68 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.92 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.53 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.46 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.37 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  21.98 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.12 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.62 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  23.16 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  24.58 
 
 		 176 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.41 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  26.67 
 
 		 199 aa  57  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.78 
 
 		 176 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.73 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.55 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.68 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.01 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.01 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  24.86 
 
 		 176 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.32 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.19 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  24.46 
 
 		 175 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  25.84 
 
 		 172 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  23.56 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.81 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  23.58 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.41 
 
 		 181 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  26.46 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  23.73 
 
 		 176 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  23.89 
 
 		 175 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  22.11 
 
 		 184 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  38.36 
 
 		 909 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3805  hydrogenase, Fe-only  36.36 
 
 		 582 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.12 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25.97 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  23.84 
 
 		 184 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  24.86 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.14 
 
 		 175 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  23.84 
 
 		 184 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  27.17 
 
 		 171 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.55 
 
 		 174 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.15 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>