177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1860 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  100 
 
 		 274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  47.45 
 
 		 277 aa  297  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  46.15 
 
 		 279 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  46.18 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  44.89 
 
 		 275 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  43.59 
 
 		 271 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  40.29 
 
 		 278 aa  235  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  33.58 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  29.74 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  30.77 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  33.21 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  31.02 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  30.74 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  28.41 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  28.25 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  30.26 
 
 		 274 aa  135  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  31.72 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  29.64 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  28.26 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  30.62 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  29.46 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  29.17 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  29.96 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  30.58 
 
 		 273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  27.44 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  29.96 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  29.89 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  26.74 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  27.88 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  28.73 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  29.67 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  25.55 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  26.71 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  29.37 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  28.88 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.55 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  29.09 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.55 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  28.25 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  28.16 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  26.13 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  26.23 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.87 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.02 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.43 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.25 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  24.73 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.25 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  26.95 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  27.57 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  25.68 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.23 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.82 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  26.06 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.47 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  33.09 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.22 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.91 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.74 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  24.44 
 
 		 189 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.91 
 
 		 176 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  22.3 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28.87 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.37 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.22 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.17 
 
 		 169 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  31.39 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.89 
 
 		 191 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  24.86 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.52 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.89 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.09 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.43 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  27.84 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.06 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.92 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  32.62 
 
 		 248 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.94 
 
 		 172 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  27.17 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.12 
 
 		 182 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.51 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.51 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  26.26 
 
 		 169 aa  53.1  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.55 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.11 
 
 		 190 aa  52.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  25.26 
 
 		 173 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.92 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  27.27 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.17 
 
 		 169 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  25.14 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.31 
 
 		 168 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  27.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  26.47 
 
 		 176 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  21.05 
 
 		 188 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.97 
 
 		 167 aa  50.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.28 
 
 		 171 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  27.66 
 
 		 169 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  22.87 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  23.16 
 
 		 173 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  25.13 
 
 		 176 aa  49.3  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>