122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4839 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  100 
 
 		 238 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  52.73 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  52.13 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  51.36 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  51.13 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  52.97 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  50.45 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  49.54 
 
 		 231 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  47.49 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  44.34 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  41.07 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  37 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  34.86 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  39.53 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  38.29 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  34.51 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  34.44 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  36.74 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  35.48 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  35.14 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  35.81 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  38.12 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  36.16 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  35.84 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  35.84 
 
 		 242 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  35.02 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  33.93 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  33.88 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  34.5 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  35.4 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  34.8 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  35.65 
 
 		 246 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  35.14 
 
 		 231 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  37.85 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  35.35 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  31.98 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  32.27 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  34.03 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  34.36 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  34.4 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  34.51 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  33.92 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  33.95 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  35.45 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  34.29 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  34.58 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  31.6 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  32.55 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  32.71 
 
 		 220 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  32.08 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  29.57 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  31.96 
 
 		 223 aa  119  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  33.33 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  31.6 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  32.41 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  32.74 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  32.27 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  32.3 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  34.43 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  33.8 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  32.08 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.46 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  30.33 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  33.33 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  30.45 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  32.41 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  31.28 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  31.96 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  29.91 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  30.84 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  30.53 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  30.81 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  32.09 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  32.71 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  32.71 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  30.4 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  30.7 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  31.22 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  28.3 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  32.24 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  29.78 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  27.91 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  30.04 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  28.24 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  25 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  26.05 
 
 		 218 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  24.06 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  26.51 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.24 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  27.27 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.98 
 
 		 174 aa  49.7  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  27.49 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  23.58 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  35.8 
 
 		 174 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.5 
 
 		 167 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.45 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.24 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1805  nitroreductase  37.29 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000108045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>