More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1055 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  35.94 
 
 
188 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  34.07 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  37.11 
 
 
189 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  33.51 
 
 
202 aa  111  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  37.63 
 
 
189 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  36.57 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  33.16 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  32.58 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  32.98 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  36.08 
 
 
189 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.2 
 
 
184 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  34.27 
 
 
188 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  34.27 
 
 
188 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.77 
 
 
191 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.75 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.74 
 
 
187 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  33.9 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  30.41 
 
 
185 aa  86.3  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  31.72 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.4 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.74 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.74 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.72 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.1 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  26.7 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.21 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.84 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.63 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  30 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.38 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.46 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.81 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.57 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.66 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.81 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.02 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  29.52 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.86 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.12 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  26.6 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  27.81 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.94 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.78 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.22 
 
 
204 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.49 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25 
 
 
345 aa  71.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.67 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  28.07 
 
 
274 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.06 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.24 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.16 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.41 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32.87 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  26.42 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.29 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  27.17 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.34 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.81 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  23.96 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  27.87 
 
 
279 aa  68.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.18 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.52 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.96 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.96 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.51 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.75 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  24.19 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  25.13 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  27.05 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  27.05 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  27.05 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.2 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  27.05 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.13 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  24.19 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.6 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.27 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  25.67 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.74 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.81 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  26.29 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.89 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  24.73 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.15 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  22.22 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  27.03 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  25 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  24.28 
 
 
163 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  27.03 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.47 
 
 
215 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.55 
 
 
167 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  26.59 
 
 
262 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  25.86 
 
 
173 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.5 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  27.53 
 
 
169 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.85 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  24.86 
 
 
170 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  26.34 
 
 
215 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  23.21 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>