More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2365 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  51.49 
 
 		 277 aa  288  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  52.55 
 
 		 279 aa  284  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  46.18 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  47.41 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  48.18 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  45.26 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  34.81 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  33.46 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  34.19 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  34.46 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  34.94 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  32.95 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  31.56 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  32.83 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  32.85 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  31.64 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  30.35 
 
 		 277 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  30.94 
 
 		 295 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  33.33 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  31.64 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  30.94 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  32.08 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  31.41 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  33.72 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  31.97 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  30.88 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  30.74 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  30.69 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  29.78 
 
 		 272 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  29.23 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  33.73 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  28.95 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  32.06 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  28.41 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  28.52 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  29.93 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  29.78 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  28.84 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.9 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.5 
 
 		 187 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  25.85 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  32 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.52 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  30.39 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  23.51 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  30.34 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  32.54 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.7 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  28.81 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.17 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.87 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  28 
 
 		 189 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  28.5 
 
 		 176 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.18 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  31.98 
 
 		 174 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.34 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  29.07 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.37 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  25.28 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.04 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  23.74 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  27.63 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.5 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  26.51 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  24.21 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.36 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25.42 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  22.95 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  27.06 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  26.79 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  24.56 
 
 		 169 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.16 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.86 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17130  4Fe-4S protein  34.83 
 
 		 516 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.29858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  25.57 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  24.31 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  27.35 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  26.6 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.62 
 
 		 176 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  26.92 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  25.36 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  25.36 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 		 62 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.49 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25.43 
 
 		 176 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1397  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 597 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0209404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1431  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.74 
 
 		 191 aa  53.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1326  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  50.98 
 
 		 498 aa  53.1  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.74 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  29.15 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  25 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  25.37 
 
 		 230 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.91 
 
 		 443 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  24.57 
 
 		 176 aa  52  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28 
 
 		 168 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2330  coenzyme F420 hydrogenase  40.38 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 131 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>