More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0708 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  100 
 
 		 171 aa  354  2.9999999999999997e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  33.14 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.18 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  37.5 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.14 
 
 		 165 aa  90.5  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.71 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  35.03 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  31.82 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.91 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.1 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.57 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.59 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  33.96 
 
 		 201 aa  80.9  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.82 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.81 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  33.74 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  30.22 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.65 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.52 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  29.17 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  29.65 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.72 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.57 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  30.46 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.86 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.14 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  29.31 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  31.89 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.07 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.07 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  30.64 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  26.4 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.43 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  28.74 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.49 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  30.67 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.65 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  31.68 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.57 
 
 		 186 aa  72  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.87 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  25.77 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  31.55 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  26.29 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  28.74 
 
 		 257 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.98 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.84 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  30.81 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  33.14 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.07 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  29.41 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.81 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.07 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.11 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  29.11 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.34 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.57 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  31.51 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  25.75 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  26.55 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  30.17 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.48 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.19 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.65 
 
 		 174 aa  67.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30.67 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1059  nitroreductase  29.38 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000184024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  32.12 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  25.64 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.72 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.17 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.52 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  32.88 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  31.14 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  25.43 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.37 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  30.25 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  29.24 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  31.55 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  28.3 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  25.86 
 
 		 329 aa  64.3  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  27.54 
 
 		 241 aa  64.3  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  27.71 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  30 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  29.56 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  22.7 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  32.89 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.59 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.56 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  27.5 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.78 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.78 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.98 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  28.74 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  29.21 
 
 		 279 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  27.91 
 
 		 169 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  28.18 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.83 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  26.92 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  23.87 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.8 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  28.95 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>