More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2492 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  100 
 
 
249 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  44.9 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  45.38 
 
 
243 aa  229  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  44 
 
 
261 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  42.86 
 
 
251 aa  224  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  42.86 
 
 
251 aa  224  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  42.58 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  43.78 
 
 
244 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  43.37 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  43.37 
 
 
244 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  43.78 
 
 
244 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  42.97 
 
 
244 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.97 
 
 
244 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.97 
 
 
244 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  43.37 
 
 
244 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  42.57 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  42.97 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  42.97 
 
 
244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  44.58 
 
 
242 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  42.23 
 
 
257 aa  210  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  41.04 
 
 
240 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  42.23 
 
 
240 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  39.92 
 
 
251 aa  206  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  36.9 
 
 
248 aa  198  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  43.25 
 
 
240 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  41.43 
 
 
240 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  41.43 
 
 
240 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  41.43 
 
 
240 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  41.43 
 
 
240 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  40.64 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  40.64 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  40.55 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  40.64 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  40.64 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  40.55 
 
 
240 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  40.16 
 
 
240 aa  186  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  40.24 
 
 
239 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  42.06 
 
 
248 aa  185  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  40.16 
 
 
240 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  41.04 
 
 
240 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  39.76 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  41.37 
 
 
240 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  41.04 
 
 
240 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  41.04 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  39.84 
 
 
240 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  35.69 
 
 
285 aa  169  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  39.84 
 
 
273 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  31.23 
 
 
269 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  35.56 
 
 
253 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  37.35 
 
 
273 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  39.15 
 
 
288 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  36.32 
 
 
273 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  37.01 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  32.41 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  39.53 
 
 
286 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  35.96 
 
 
246 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  36.32 
 
 
254 aa  142  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  31.85 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.5 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  40.52 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  34.08 
 
 
246 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  38.94 
 
 
304 aa  132  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  34.14 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  33.63 
 
 
246 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  35.41 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  37.18 
 
 
253 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  35.16 
 
 
274 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  37.89 
 
 
276 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  37.36 
 
 
317 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  29.84 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  35.52 
 
 
316 aa  118  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  37.45 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  35.87 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  34.43 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  35.16 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  27.31 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  32.26 
 
 
248 aa  108  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  27.38 
 
 
247 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.35 
 
 
245 aa  99  7e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.34 
 
 
170 aa  95.9  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  30.99 
 
 
251 aa  95.5  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  34.97 
 
 
270 aa  92  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  37.95 
 
 
238 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.4 
 
 
204 aa  85.5  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1633  nitroreductase  31.92 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  27.62 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.13 
 
 
165 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  31.55 
 
 
171 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.24 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.42 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.65 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  31.28 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.78 
 
 
184 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  28.98 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.02 
 
 
174 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.74 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  27.17 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.5 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.57 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.32 
 
 
175 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>