More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0536 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  100 
 
 
172 aa  357  5e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  41.28 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  37.79 
 
 
172 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  37.87 
 
 
175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  37.21 
 
 
172 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  35.84 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  40.38 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  34.3 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  34.3 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  34.91 
 
 
169 aa  112  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  35.33 
 
 
176 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  32.56 
 
 
195 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  32.93 
 
 
170 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  36.71 
 
 
173 aa  101  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  36.77 
 
 
170 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  34.64 
 
 
170 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  35.71 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  34.32 
 
 
184 aa  97.8  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.57 
 
 
163 aa  95.5  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.19 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  33.7 
 
 
176 aa  90.9  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  33.72 
 
 
167 aa  90.5  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.68 
 
 
278 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  32.95 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.14 
 
 
168 aa  89  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  32.37 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.53 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.03 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.55 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.14 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.65 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  32.6 
 
 
191 aa  80.5  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  33.91 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  30.56 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  32.2 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  33.33 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.4 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.66 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.12 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.21 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.4 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.57 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.73 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.73 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.29 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  31.58 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  30.68 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.03 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  32.76 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.94 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.7 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.27 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.55 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  30.95 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.7 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.73 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  27.89 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.86 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  28.31 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  32.2 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  28.57 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.4 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  28.57 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.55 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  30.6 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  31.01 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  30.32 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.11 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.78 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.88 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  30.38 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  30.38 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.5 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  30 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.76 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.16 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.06 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.14 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  30.77 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.73 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  24.86 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  28.86 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  31.82 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  27.33 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.73 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.04 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  26.29 
 
 
274 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.84 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  27.37 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  26.86 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  24.67 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.23 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.12 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.44 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  27.98 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  30.23 
 
 
321 aa  65.1  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  24.14 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  29.31 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>