272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1631 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  100 
 
 
263 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  51.33 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  42.28 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  40.15 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  40.22 
 
 
274 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  41.57 
 
 
275 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  38.41 
 
 
274 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  36.86 
 
 
274 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  39.93 
 
 
272 aa  188  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  38.57 
 
 
273 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  35.29 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  35.9 
 
 
272 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  36.13 
 
 
284 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  37.91 
 
 
275 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  35.61 
 
 
274 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  33.94 
 
 
282 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  38.1 
 
 
271 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  35.82 
 
 
274 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  37.41 
 
 
295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  33.94 
 
 
272 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  32.49 
 
 
278 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  31.99 
 
 
275 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  31.88 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  34.17 
 
 
274 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  31.72 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  31.09 
 
 
279 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  30.08 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  30.45 
 
 
278 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.14 
 
 
273 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  25.26 
 
 
272 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  30.26 
 
 
275 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.78 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  31.02 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  29.67 
 
 
274 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  28.52 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  28.87 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  24.21 
 
 
272 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  30.11 
 
 
263 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  32.04 
 
 
187 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.14 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.47 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.81 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.43 
 
 
184 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.67 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.06 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  29.19 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.29 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.1 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  26.6 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  28.31 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  28.07 
 
 
189 aa  72  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  31.01 
 
 
188 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  28.74 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.3 
 
 
165 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  34.38 
 
 
168 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.33 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.49 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.98 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.99 
 
 
170 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.71 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  26.83 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  24.66 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  27.16 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  30.53 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  24.32 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  28 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.34 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  24.71 
 
 
194 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  24.06 
 
 
202 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.32 
 
 
177 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  23.3 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.81 
 
 
191 aa  62.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  23.33 
 
 
188 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  31.1 
 
 
163 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.81 
 
 
214 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  31.21 
 
 
172 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.55 
 
 
174 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  30.64 
 
 
172 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30.81 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.05 
 
 
178 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.81 
 
 
194 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  23.03 
 
 
192 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  27.71 
 
 
176 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  23.17 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  29.56 
 
 
176 aa  59.3  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  22.91 
 
 
180 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  27.57 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.5 
 
 
176 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  33.08 
 
 
185 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  27.68 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  23.67 
 
 
176 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  28.74 
 
 
186 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.57 
 
 
192 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25.84 
 
 
166 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
188 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.93 
 
 
169 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.09 
 
 
178 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  29.01 
 
 
187 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.81 
 
 
167 aa  55.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  26.14 
 
 
175 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>