More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0777 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  100 
 
 
275 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  45.09 
 
 
274 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  41.61 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  44.19 
 
 
262 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  40.88 
 
 
274 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  40.29 
 
 
272 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  40.44 
 
 
272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  40.29 
 
 
275 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  38.83 
 
 
273 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  41.57 
 
 
263 aa  205  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  40.81 
 
 
273 aa  204  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  39.42 
 
 
274 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  38.24 
 
 
273 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  41.91 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  34.31 
 
 
274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  37.18 
 
 
282 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  38.97 
 
 
271 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  37.73 
 
 
284 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  35 
 
 
278 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  35.04 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  34.07 
 
 
275 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  33.45 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  32.97 
 
 
277 aa  163  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  33.46 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  34.43 
 
 
295 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  34.46 
 
 
273 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  33.94 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  32.47 
 
 
279 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  35.02 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  31.72 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  33.58 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  32.23 
 
 
275 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  26.41 
 
 
273 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  25.18 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  28.07 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  29.44 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.18 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.87 
 
 
196 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.27 
 
 
187 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  28.36 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  30.49 
 
 
185 aa  89  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.93 
 
 
190 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.53 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  31.46 
 
 
202 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  25.26 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.65 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.47 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.92 
 
 
188 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  27.15 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.56 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.32 
 
 
190 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  29.7 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.27 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  22.86 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.39 
 
 
191 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.89 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  31.06 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  31.06 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26.95 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.23 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  29.71 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  29.23 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  32.34 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.94 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.26 
 
 
174 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.45 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.78 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.12 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  28.92 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  32.98 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.06 
 
 
165 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  29.7 
 
 
163 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  34.35 
 
 
189 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  29.41 
 
 
176 aa  63.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.94 
 
 
194 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  24.86 
 
 
177 aa  62.4  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
215 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  26.22 
 
 
191 aa  62  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  27.81 
 
 
189 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  33.33 
 
 
174 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  28.43 
 
 
178 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  29.59 
 
 
184 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  49.15 
 
 
171 aa  62  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.32 
 
 
178 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.06 
 
 
184 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.99 
 
 
167 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  27.06 
 
 
168 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  24.64 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  24.64 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  24.64 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  24.64 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.05 
 
 
181 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  31.25 
 
 
204 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  28.49 
 
 
189 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  25.75 
 
 
192 aa  60.1  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.96 
 
 
191 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  33.12 
 
 
176 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  24.53 
 
 
215 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  24.53 
 
 
215 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  24.53 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>