More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3391 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  100 
 
 
284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  42.91 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  39.42 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  39.78 
 
 
274 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  37.73 
 
 
273 aa  205  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  37.45 
 
 
275 aa  182  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  37.73 
 
 
275 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  36.13 
 
 
263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  36.86 
 
 
274 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  35 
 
 
273 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  33.57 
 
 
272 aa  175  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  37.59 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  35.66 
 
 
274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  36.43 
 
 
282 aa  172  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  35.64 
 
 
273 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  32.97 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  34.64 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  34.63 
 
 
278 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  31.99 
 
 
265 aa  159  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  34.67 
 
 
262 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  31.88 
 
 
274 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  32.73 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  32.09 
 
 
275 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  29.04 
 
 
275 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  35.23 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  30.55 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  28.17 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  32.99 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  30.74 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.78 
 
 
273 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  32.08 
 
 
279 aa  126  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  30.88 
 
 
273 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  29.17 
 
 
274 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  26.86 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  30.66 
 
 
271 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.15 
 
 
272 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.47 
 
 
345 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  29.01 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  29.35 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  28.19 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  27.8 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  26.21 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.11 
 
 
191 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  29.03 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.64 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.07 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.94 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.47 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.11 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  26.21 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.73 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.59 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.84 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.73 
 
 
215 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  31.47 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  26.94 
 
 
163 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  31.47 
 
 
191 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  25.73 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  27.23 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.81 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.88 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  23.4 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.48 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.72 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.11 
 
 
166 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  30 
 
 
171 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.74 
 
 
178 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.24 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.25 
 
 
170 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  23.53 
 
 
188 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  34.04 
 
 
189 aa  62.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.7 
 
 
173 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.59 
 
 
186 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25.39 
 
 
176 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  27.1 
 
 
191 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.37 
 
 
168 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  30 
 
 
209 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  23.19 
 
 
215 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2937  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.88 
 
 
63 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.77 
 
 
176 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27 
 
 
178 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  29.07 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.34 
 
 
179 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.5 
 
 
186 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.14 
 
 
185 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  23.89 
 
 
192 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  23.43 
 
 
175 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  24.71 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.18 
 
 
174 aa  55.8  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  24.86 
 
 
171 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  23.37 
 
 
186 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0074  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 
62 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112658  normal  0.013412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  29.85 
 
 
188 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  22.12 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.37 
 
 
186 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>