169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18390 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  100 
 
 		 295 aa  618  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  33.45 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  31.82 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  32.62 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  32.39 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  33.45 
 
 		 275 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  30.82 
 
 		 277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  31.77 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  27.18 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  27.46 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  29.04 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.26 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  29.72 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  27.31 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  28.47 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  28.12 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  25 
 
 		 272 aa  92.8  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  29.33 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  28.47 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  26.79 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  28.03 
 
 		 273 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  29.86 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  28.78 
 
 		 263 aa  85.9  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.34 
 
 		 272 aa  85.9  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  25.47 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  23.59 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  25.17 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  25.74 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  25.56 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  24.24 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  26.67 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  24.91 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  23.22 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  27.21 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  25.36 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.16 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  26.97 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.43 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  24.18 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.38 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  21.75 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  26.28 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  22.81 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  23.59 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.23 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.72 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.64 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  22.96 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.46 
 
 		 186 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  23.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  23.59 
 
 		 169 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  23.9 
 
 		 215 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  24.1 
 
 		 169 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  22.65 
 
 		 182 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.75 
 
 		 165 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  27.18 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  25.11 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  24.74 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  26.67 
 
 		 166 aa  50.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  26.48 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  24.39 
 
 		 176 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  28.44 
 
 		 190 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0641  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.56 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.614962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.39 
 
 		 194 aa  49.3  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  28.09 
 
 		 196 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  21.21 
 
 		 187 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  24.67 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  23.5 
 
 		 181 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  23.5 
 
 		 181 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2152  molybdopterin oxidoreductase  38.46 
 
 		 880 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  23.36 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  25.74 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.84 
 
 		 898 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  23.88 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  23.78 
 
 		 188 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0106  nitroreductase  25.27 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0309697  normal  0.07675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  24.58 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.07 
 
 		 62 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.432587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  26.04 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2100  ferredoxin  34.29 
 
 		 609 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.624892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  28.16 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.51 
 
 		 191 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  22.9 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  22.9 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  22.9 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  22.9 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  24.58 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  22.9 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  41.27 
 
 		 582 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  22.9 
 
 		 215 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.5 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.11 
 
 		 1004 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30.51 
 
 		 214 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  23.59 
 
 		 202 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  26.9 
 
 		 185 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  20.32 
 
 		 176 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  24.37 
 
 		 232 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0236  hydrogenase, Fe-only  39.68 
 
 		 586 aa  45.8  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.660897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  23.38 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  23.81 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>