More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3287 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  100 
 
 		 273 aa  568  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  66.91 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  61.4 
 
 		 272 aa  364  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  47.45 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  46.93 
 
 		 278 aa  270  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  48.18 
 
 		 274 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  45.26 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  42.03 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  40.88 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  38.69 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  36.13 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  38.69 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  37.82 
 
 		 273 aa  205  7e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  38.24 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  37.96 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  39.56 
 
 		 271 aa  185  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  35.29 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  33.58 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  33.33 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  35 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  34.05 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  37.16 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  32.97 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  31.46 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  33.98 
 
 		 279 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  31.16 
 
 		 274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  32.95 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  31.02 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  29.63 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  32.72 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  31.5 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.09 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  25.45 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  23.67 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.41 
 
 		 287 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.81 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  26.28 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  25.59 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  26.03 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  21.86 
 
 		 345 aa  82  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  23.95 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.89 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.42 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.82 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.46 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.89 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.49 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.25 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.32 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.49 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  27.88 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.87 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.98 
 
 		 165 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  25.95 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.06 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.62 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.06 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  42.86 
 
 		 171 aa  62  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.47 
 
 		 178 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25 
 
 		 188 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  31.68 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.24 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  32.02 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  28.57 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  24.1 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  27.93 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.05 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  29.69 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.59 
 
 		 163 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.83 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  28.99 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.12 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  29.09 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.12 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.58 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  24.6 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.12 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  29 
 
 		 180 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  24.64 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.37 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  30.43 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  26.21 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.12 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.49 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  24.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  24.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.56 
 
 		 194 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  24.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  24.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  43.08 
 
 		 172 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  24.41 
 
 		 215 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  43.1 
 
 		 173 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  36.76 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0805  nitroreductase  36.92 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.12 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  47.46 
 
 		 178 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  44.44 
 
 		 177 aa  53.9  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1820  NADH dehydrogenase subunit I  41.67 
 
 		 211 aa  53.5  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000189199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>