196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2435 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  100 
 
 		 303 aa  624  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  41.52 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  27.21 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  26.6 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  27.43 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  27.65 
 
 		 275 aa  99.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  25.63 
 
 		 277 aa  99  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  29.55 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  29.72 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  26.28 
 
 		 273 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  28 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  26.13 
 
 		 274 aa  92.4  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  25.85 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  26.21 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.43 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  27.15 
 
 		 275 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  25.68 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  26.39 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  28.41 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  28.08 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  21.5 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  27.67 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  27.98 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  27.37 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  25.45 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  24.05 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  25.09 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  24.66 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  26.1 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  25.55 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  26.96 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  28.86 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  21.89 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  22.03 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.36 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  24.54 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  23.71 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.72 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  20.93 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.94 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  24.29 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  21.18 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  19.8 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.35 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  25.95 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  24.64 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.73 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  30.18 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.24 
 
 		 252 aa  52.8  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3017  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.44 
 
 		 57 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0212727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17130  4Fe-4S protein  36.23 
 
 		 516 aa  49.7  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.29858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00580  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  37.93 
 
 		 62 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00222598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0088  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2729  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.396003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  32.86 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  22.54 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0374  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 355 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0265  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  31.03 
 
 		 427 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  25 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.07 
 
 		 191 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  24.77 
 
 		 180 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1221  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.07 
 
 		 58 aa  47  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  27.65 
 
 		 236 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  36.36 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1283  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 566 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  23.76 
 
 		 196 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  24.09 
 
 		 238 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 368 aa  46.6  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  25.46 
 
 		 184 aa  46.2  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2063  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 385 aa  46.2  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000008917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1955  ferredoxin  32.88 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356544  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  25.5 
 
 		 188 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1072  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 233 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0849  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 58 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.295211  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1097  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 58 aa  45.8  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 370 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  26.4 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3421  ferredoxin  38.18 
 
 		 58 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  26.67 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0800  hypothetical protein  32.39 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  26.44 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0588  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.08 
 
 		 76 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0043  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 59 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2793  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  36.84 
 
 		 97 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00379398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1067  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 77 aa  45.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  24.76 
 
 		 173 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00640  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  37.93 
 
 		 62 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000382755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1045  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1110  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38 
 
 		 62 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0634  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  25.42 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2403  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.27 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1912  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.1 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  28.65 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  28.65 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1578  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 58 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0316883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.38 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.20206 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>