228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1266 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  100 
 
 
282 aa  580  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  89.57 
 
 
278 aa  521  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  45.26 
 
 
273 aa  264  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  47.45 
 
 
272 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  46.35 
 
 
272 aa  248  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  39.86 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  38.57 
 
 
274 aa  198  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  35.87 
 
 
275 aa  198  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  38.35 
 
 
274 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  37.18 
 
 
275 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  37.78 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  34.06 
 
 
273 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  38.63 
 
 
274 aa  175  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  36.43 
 
 
284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  33.94 
 
 
263 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  33.7 
 
 
274 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  35.59 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  35 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  33.21 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  32.26 
 
 
273 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  35 
 
 
295 aa  156  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  31.02 
 
 
262 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  36.36 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  30.11 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  31.14 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  29.86 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  30.69 
 
 
273 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  32.99 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  29.47 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  29.37 
 
 
277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  29.52 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  26.55 
 
 
273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  28.88 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  25.26 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.26 
 
 
278 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  25.26 
 
 
272 aa  99  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.8 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  27.1 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  28.74 
 
 
303 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.09 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.14 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.13 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  28.49 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.78 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.89 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.09 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  26.26 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.11 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.21 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  23.28 
 
 
202 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.13 
 
 
190 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  25.43 
 
 
303 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.6 
 
 
215 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.65 
 
 
178 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.03 
 
 
194 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.1 
 
 
170 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  25.6 
 
 
215 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.6 
 
 
215 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  26.09 
 
 
215 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.49 
 
 
194 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.86 
 
 
188 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.7 
 
 
168 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.56 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.55 
 
 
165 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.59 
 
 
172 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  30.99 
 
 
188 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.6 
 
 
174 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  25.6 
 
 
215 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  28.49 
 
 
186 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.75 
 
 
194 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.11 
 
 
196 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.12 
 
 
215 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.98 
 
 
178 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  27.14 
 
 
191 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  23.67 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.79 
 
 
166 aa  56.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.32 
 
 
204 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.52 
 
 
188 aa  55.8  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.32 
 
 
176 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  25.41 
 
 
178 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  25.65 
 
 
184 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.24 
 
 
176 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.11 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.97 
 
 
188 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.31 
 
 
214 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.26 
 
 
186 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  36.84 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30 
 
 
186 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  24.61 
 
 
180 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.46 
 
 
173 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.39 
 
 
173 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  33.33 
 
 
232 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.97 
 
 
175 aa  52.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  28.95 
 
 
546 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  28.57 
 
 
195 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  33.33 
 
 
228 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>