More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1872 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  100 
 
 
232 aa  478  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  33.89 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.8 
 
 
190 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.66 
 
 
190 aa  85.5  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.64 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.94 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.74 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.75 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.87 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.19 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.5 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  28.14 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.69 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  29.84 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.12 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  28.37 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.15 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.54 
 
 
584 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.47 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  30.3 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  28.87 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  25.52 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  29.32 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.92 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.5 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.21 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  33.55 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  29.26 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.61 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  26.73 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  25.89 
 
 
177 aa  72  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  33.58 
 
 
188 aa  72  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.65 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.73 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.14 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  33.58 
 
 
188 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.72 
 
 
187 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  28.04 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.64 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  29.3 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.84 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2320  nicotinate-nucleotide/dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
1580 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.82 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  25.84 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2476  nitroreductase  34.33 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  28.44 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  26.79 
 
 
546 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  26.96 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  26.67 
 
 
167 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  28.36 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  26.5 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  23.44 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  26.36 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.46 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  30.26 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  27.01 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  27.01 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  27.01 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.95 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  26.02 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  27.01 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.62 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.27 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  27.52 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  27.36 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  27.36 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.59 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.65 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.85 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1116  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.05 
 
 
214 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  27.96 
 
 
215 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.34 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  27.96 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  30.21 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  29.03 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  27.86 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  29.8 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  29.03 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.88 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  23.83 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1683  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.92 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000634411  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1562  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.35 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.249617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.19 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  26.87 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.78 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  27.49 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  26.54 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2909  nitroreductase  28.37 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.97 
 
 
324 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  33.79 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.37 
 
 
169 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.71 
 
 
345 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  27.36 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.34 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.6 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.35 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  29.38 
 
 
171 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>