143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1059 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1059  nitroreductase  100 
 
 		 160 aa  331  3e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000184024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  32.19 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.63 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  31.79 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.8 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  27.61 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.56 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  33.11 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.38 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  28.48 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.56 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.41 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.27 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  33.8 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  29.87 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  30.67 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.52 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.66 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.13 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  30.91 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.67 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  26.82 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  26.85 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.17 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.49 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.17 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.64 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  27.85 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  26.92 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  23.64 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.08 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.4 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.95 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  30.07 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.71 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.47 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  20.12 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  24.55 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.38 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.47 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  25.15 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  25.15 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  23.6 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.86 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  29.03 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.06 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.83 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  31.58 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  31.58 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  29.82 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  25.3 
 
 		 274 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  28.95 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  26.38 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  22.16 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.54 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  27.93 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.47 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  24 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  25.9 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.21 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.9 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  23.57 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  28.66 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.79 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  23.61 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  24.58 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  25.15 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  25.31 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.71 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  24.24 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  23.81 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.57 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  23.68 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  27.44 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  24.54 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  23.15 
 
 		 204 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  24.38 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  28.03 
 
 		 172 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.95 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  23.37 
 
 		 274 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  25.95 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  26.71 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  24.55 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  24.54 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  25.45 
 
 		 329 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  25.33 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.33 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  21.84 
 
 		 274 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  23.53 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  23.03 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  26.79 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  25.45 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  25 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  25.15 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  22.62 
 
 		 272 aa  48.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  23.6 
 
 		 278 aa  48.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  29.57 
 
 		 321 aa  48.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  21.82 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  28.48 
 
 		 214 aa  47.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  29.01 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>