253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2018 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  100 
 
 		 188 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  33.52 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.67 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  36.65 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  32 
 
 		 202 aa  90.9  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.64 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  32.66 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  31.79 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  30.56 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  31.79 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  32.72 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  26.78 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  30.48 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.7 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  30.63 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  27.14 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  27.47 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  29.41 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.37 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.58 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.12 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.32 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.81 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.96 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.96 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  31.76 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.12 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  25.71 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.12 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  27.22 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  26.26 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  27.17 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  27.45 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.72 
 
 		 334 aa  62  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  28.39 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  25.74 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.39 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.38 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.27 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  27.23 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  26.27 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  25.98 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.66 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  25.88 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  26.14 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  24.75 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  25 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.34 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.57 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  28.18 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.53 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  28.99 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.58 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.9 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  27.87 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  23.56 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.13 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  25.28 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.89 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  28.05 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  25.71 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  24.86 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  37.11 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  28 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.79 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  29.01 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  25 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  25.71 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.26 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.14 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  26.19 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  24.32 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.41 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  24.06 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  25.13 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  26.47 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  31.16 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.35 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  22.78 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  23.47 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  24.31 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  25 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  25 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.65 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  25.28 
 
 		 271 aa  52  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  25.67 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  27.22 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  27.22 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  26.63 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  38.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  22.84 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  38.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  27.22 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1122  nitroreductase  25 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  23.91 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  26.63 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  22.94 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  24.12 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  29.34 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  25.52 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>