109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1363 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  40.44 
 
 
184 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.78 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  30.59 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  26.7 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  30.77 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.27 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.24 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  29.17 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.9 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.28 
 
 
191 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.28 
 
 
214 aa  61.6  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  25.9 
 
 
188 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  25.66 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  26.2 
 
 
169 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  27.49 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  27.27 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  27.27 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  26.52 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  29.84 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.89 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  26.74 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.49 
 
 
187 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1059  nitroreductase  23.81 
 
 
160 aa  51.2  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000184024  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.27 
 
 
175 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  25.58 
 
 
172 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.67 
 
 
196 aa  51.2  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  27.07 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  27.16 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  23.33 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  23.94 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.14 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  24.87 
 
 
273 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.53 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.95 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  26.54 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  25 
 
 
275 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.64 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  24.86 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  28.81 
 
 
170 aa  47.8  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  25.85 
 
 
285 aa  47.4  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  27.84 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  24.1 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  28.83 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  25.67 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.61 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  26.18 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  27.47 
 
 
274 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.04 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  26.83 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  24.28 
 
 
274 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  24.4 
 
 
303 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  23.66 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3917  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.29 
 
 
248 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.26 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  27.38 
 
 
187 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  27.43 
 
 
169 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1270  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.03 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  23.93 
 
 
275 aa  44.7  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.56 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.27 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  27.22 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0341  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.84 
 
 
247 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0824  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.84 
 
 
247 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.88 
 
 
167 aa  44.3  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  24.73 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  25.84 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  22.46 
 
 
277 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.57 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  27.13 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  26.16 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  24.72 
 
 
238 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  25.42 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  23.32 
 
 
217 aa  43.9  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  24.59 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0794  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.84 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.84 
 
 
249 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.28 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  24.1 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  28.08 
 
 
303 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  25.97 
 
 
273 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.68 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  24.73 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  21.69 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  25 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  24.14 
 
 
274 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  22.09 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.63 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  24 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  24.85 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.75 
 
 
188 aa  42.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  23.94 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  24.03 
 
 
278 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  22.09 
 
 
368 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  23.89 
 
 
253 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.86 
 
 
186 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  26.21 
 
 
246 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  27.71 
 
 
173 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>