198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6222 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  100 
 
 		 246 aa  511  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  71.43 
 
 		 247 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  70.42 
 
 		 254 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  70.42 
 
 		 254 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  69.33 
 
 		 242 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  73.76 
 
 		 224 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  67.62 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  60.34 
 
 		 237 aa  310  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  64.29 
 
 		 229 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  60.92 
 
 		 239 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  61.11 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  61.11 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  61.11 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  61.4 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  61.26 
 
 		 235 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  61.26 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  59.66 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  61.82 
 
 		 235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  63.06 
 
 		 229 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  54.2 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  54.95 
 
 		 236 aa  251  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  55.11 
 
 		 258 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  54.13 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  54.63 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  53.64 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  49.77 
 
 		 228 aa  221  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  52.25 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  51.35 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  47.51 
 
 		 231 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  48.17 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  48.6 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  46.4 
 
 		 224 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  47.06 
 
 		 223 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  46.36 
 
 		 223 aa  198  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  43.84 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  42.79 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  44.09 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  43.56 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  41.82 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  40.91 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  37.27 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  41.95 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  38.64 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  40.55 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  39.73 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  39.32 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  38.64 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  38.81 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  39.32 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  40.18 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  37.56 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  36.11 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  39.09 
 
 		 232 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  36.09 
 
 		 241 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  36.87 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  36.87 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  38 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  36.41 
 
 		 222 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  34.82 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  36.44 
 
 		 235 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  35.65 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  36.07 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  34.7 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  32.6 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  36.53 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  35.78 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  32.13 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  34.4 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  33.63 
 
 		 231 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  34.67 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  34.1 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  35.68 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  35.21 
 
 		 219 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  33.92 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  32.89 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  31.6 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  33.78 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  32.59 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  32.44 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  31.88 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  30.59 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  30.67 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  25.66 
 
 		 223 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  27.19 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  25.47 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  27.39 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  26.89 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.7 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.78 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  23.86 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.5 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.27 
 
 		 196 aa  62  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.06 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.62 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.65 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  24.66 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.62 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.62 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  41.82 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  23.77 
 
 		 347 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>