170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1048 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  98.17 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  67.58 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  47.53 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  51.38 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  47.44 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  48.21 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  43.95 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  45.74 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  44.66 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  41.94 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  38.57 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  41.47 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  40.36 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  36.49 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  39.62 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  40.99 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  40.87 
 
 		 239 aa  147  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  41.18 
 
 		 228 aa  147  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  40.09 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  40.65 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  40.93 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  37.96 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  38.31 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  37.44 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  39.17 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  38.43 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  38.71 
 
 		 235 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  41.31 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  39.35 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  37.04 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  35.32 
 
 		 229 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  36.11 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  36.11 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  38.36 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  37.56 
 
 		 258 aa  136  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  37.14 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  35.65 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  35.71 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  36.19 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  35.75 
 
 		 257 aa  134  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  36.99 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  38.25 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  38.18 
 
 		 239 aa  131  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  36.92 
 
 		 254 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  37.44 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  37.33 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  37.33 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  37.79 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  34.56 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  35.24 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  35.21 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  40.39 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  40.39 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  32.24 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  37.33 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  36.2 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  35.68 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  36.04 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  33.03 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  35.1 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  34.13 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  34.56 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  36.28 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  32.86 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  32.24 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  30.84 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  33.18 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  32.73 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  35.61 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  35.07 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  31.88 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  30.81 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  30.2 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  32.21 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  29.19 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  26.46 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  26.34 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  27.88 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  25.56 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  29.52 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  28.23 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  26.85 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  26.22 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  24.66 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  25.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.09 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  24.66 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.82 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.63 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.77 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  26.87 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  22.16 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.89 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.27 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.62 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.22 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  27.94 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>