257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0170 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  100 
 
 
221 aa  457  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  59.91 
 
 
223 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  60.81 
 
 
223 aa  272  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  49.55 
 
 
223 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  52.73 
 
 
226 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  47.27 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  50.67 
 
 
222 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  50.67 
 
 
222 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  49.33 
 
 
221 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  50.22 
 
 
222 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  49.32 
 
 
221 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  47.44 
 
 
219 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  50.24 
 
 
225 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  47.44 
 
 
219 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  48.2 
 
 
221 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  45.62 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  46.05 
 
 
220 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  42.15 
 
 
225 aa  189  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  43.69 
 
 
231 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  42.79 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  43.44 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  42.79 
 
 
239 aa  179  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  41.89 
 
 
242 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  38.81 
 
 
228 aa  175  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  40.99 
 
 
242 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  40.99 
 
 
242 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  40.99 
 
 
242 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  40.81 
 
 
235 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  40.44 
 
 
235 aa  168  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  40 
 
 
233 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  40.99 
 
 
242 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  40.54 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  38.91 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  36.82 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  39.07 
 
 
236 aa  161  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  38.99 
 
 
239 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  40 
 
 
249 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  38.67 
 
 
254 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  40.57 
 
 
224 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  37.73 
 
 
247 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  38.22 
 
 
254 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  37.83 
 
 
236 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  38.68 
 
 
228 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  37.95 
 
 
231 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  37.27 
 
 
246 aa  154  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  35.78 
 
 
223 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  38.64 
 
 
237 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  38.64 
 
 
258 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  37.5 
 
 
257 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  37.84 
 
 
224 aa  148  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  35.27 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  35.29 
 
 
241 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  35.02 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  33.64 
 
 
220 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  34.68 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  37.73 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  35.91 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  31.6 
 
 
240 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  36.59 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  36.1 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  35.65 
 
 
225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  35.09 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  31.96 
 
 
225 aa  125  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  30.73 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  28.77 
 
 
227 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  35.59 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  32.27 
 
 
238 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  29.36 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  29.36 
 
 
244 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  27.8 
 
 
234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  29.6 
 
 
223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  28.44 
 
 
232 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  26.46 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  28.25 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  26.91 
 
 
225 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  30.7 
 
 
231 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  29.44 
 
 
230 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  27.48 
 
 
231 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  29.22 
 
 
229 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  27.1 
 
 
215 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  27.03 
 
 
241 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  29.07 
 
 
270 aa  99  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  29.96 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  29.3 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.51 
 
 
221 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  26.17 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  26.55 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  32.21 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  32.21 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.22 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.87 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.54 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  29.05 
 
 
189 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  27.71 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.47 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  26.24 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  50 
 
 
174 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  45.1 
 
 
169 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  44.78 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>