216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2142 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  100 
 
 		 236 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  80.44 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  79.56 
 
 		 257 aa  384  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  67.63 
 
 		 245 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  66.22 
 
 		 231 aa  322  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  57.51 
 
 		 235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  56.65 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  61.4 
 
 		 229 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  60.89 
 
 		 229 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  56.52 
 
 		 231 aa  271  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  56.65 
 
 		 235 aa  271  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  59.56 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  57.78 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  57.78 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  57.78 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  54.95 
 
 		 247 aa  254  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  57.33 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  54.95 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  55.41 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  52.44 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  52.79 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  53.6 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  52.7 
 
 		 254 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  52.47 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  50.68 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  52.65 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  48.09 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  50.88 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  46.43 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  44.64 
 
 		 224 aa  197  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  44 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  43.95 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  41.78 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  43.95 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  41.7 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  40.09 
 
 		 233 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  40 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  40.53 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  39.73 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  37.83 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  40.18 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  37.78 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  37.44 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  38.67 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  38.18 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  39.55 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  34.39 
 
 		 232 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  33.19 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  32.3 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  38.46 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  38.46 
 
 		 222 aa  138  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  38.01 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  36.65 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  33.89 
 
 		 231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  40.18 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  36.73 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  39.52 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  34.65 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  32.88 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  38.57 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  35.87 
 
 		 220 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  34.38 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  31.51 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  35.94 
 
 		 221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  31.44 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  30.74 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  36.2 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  32.73 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  34.84 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  29.57 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  27.85 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  32.03 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  32.74 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  29.71 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  29.13 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  28.89 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  28.25 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  29.15 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  28.7 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  30.67 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  30.77 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  29.28 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  28 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28.26 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  29.78 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.76 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  27.43 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  26.96 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.49 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  24.89 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.81 
 
 		 187 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.51 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  35.21 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.52 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.74 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  49.02 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0657  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1084  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1209  nitroreductase family protein  27.38 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0494654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  44.9 
 
 		 177 aa  49.7  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>