117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1973 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  100 
 
 		 244 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  54.51 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  53.6 
 
 		 232 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  56.05 
 
 		 232 aa  255  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  53.85 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  52.63 
 
 		 231 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  52.21 
 
 		 231 aa  241  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  58.11 
 
 		 230 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  53.46 
 
 		 215 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  44.34 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  42.92 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  44.02 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  35.05 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  36.11 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  34.09 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  34.72 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  35.14 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  35.14 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  34.36 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  34.26 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  34.53 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  33.62 
 
 		 235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  34.91 
 
 		 236 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  32.02 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  34.93 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  34.25 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  34.1 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  34.85 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  34.55 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  35.59 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  34.7 
 
 		 258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  34.12 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  34.93 
 
 		 239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  33.64 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  33.03 
 
 		 223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  31.58 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  34.43 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  31.8 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  33.94 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  30.8 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  35.32 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  30.74 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  33.33 
 
 		 223 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  35.05 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  34.91 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  33.96 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  35.05 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  35.05 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  33.94 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  30.73 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  31.55 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  33.49 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  35.35 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  32.27 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  34.4 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  32.86 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  31.74 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  29.36 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  28.7 
 
 		 229 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  33.48 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  33.18 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  28.44 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.58 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  32.75 
 
 		 232 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  32.75 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  30.88 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  28.45 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  32.43 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  31.08 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  27.8 
 
 		 224 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  29.17 
 
 		 226 aa  98.6  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  29.44 
 
 		 220 aa  98.6  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  28.57 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  27.44 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  31.08 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  30.8 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  30.8 
 
 		 222 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  32.09 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  30.36 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  29.63 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  32.43 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  26.98 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  29.19 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  29.19 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  28.63 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  27.57 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  27.01 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  24.12 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.85 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  24.1 
 
 		 178 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  24.88 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.42 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  24 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  23.28 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  23.11 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  25.23 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  25.97 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  21.43 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  22.6 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  24.29 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>