209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6984 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  100 
 
 		 229 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  45.58 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  48.18 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  45.13 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  46.82 
 
 		 228 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  45.33 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  43.44 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  43.61 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  44.14 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  44.49 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  45.79 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  43.89 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  42.99 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  43.64 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  42.08 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  43.18 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  42.08 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  41.44 
 
 		 254 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  43.75 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  44.09 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  40.81 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  40 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  40.91 
 
 		 237 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  42.48 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  40 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  40.54 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  43.05 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  37.95 
 
 		 257 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  38.5 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  38.25 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  39.09 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  38.18 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  38.64 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  36.36 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  37.79 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  39.11 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  39.82 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  39.82 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  39.82 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  33.94 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  35.16 
 
 		 220 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  34.42 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  35.02 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  35.32 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  34.82 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  33.94 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  32.86 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  34.4 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  34.4 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  33.03 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  33.03 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  33.94 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  34.86 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  33.03 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  33.18 
 
 		 221 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  37.02 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  34.52 
 
 		 221 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  36.54 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  30.88 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  30.41 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  32.57 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  29.39 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  30.45 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  30.45 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  30.14 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  31.22 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  28.7 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  28.83 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  30.05 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.22 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  28.04 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  30.04 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  27.65 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  29.28 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  28.7 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  29.13 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  28.38 
 
 		 241 aa  94.7  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  29.38 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  27.54 
 
 		 270 aa  92  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  27.6 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  26.7 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  27.03 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  25.35 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  25.94 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  27.63 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  27.03 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  26.2 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  26.7 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  26.51 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.75 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25.13 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.94 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  26.42 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.6 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  24.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  26.41 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  24.89 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.33 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  27.06 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>