218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3141 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  100 
 
 		 237 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  53.33 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  40.93 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  36.2 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  35 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  34.44 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  36.36 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  34.33 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  35.75 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  35.91 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  35 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  35.35 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  36.77 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  38.07 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  36.36 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  34.09 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  33.9 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  31.8 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  34.88 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  35.19 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  34.33 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  34.98 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  32.42 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  33.61 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  34.68 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  32.24 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  34.1 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  31.78 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  33.18 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  31.36 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  32.55 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  32.19 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  31.17 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  28.83 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  32.26 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  32.87 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  34.1 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  34.1 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  30.88 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  32.86 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  32.16 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  31.6 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  35.02 
 
 		 242 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  32.27 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  32.74 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  31.31 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  32.42 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  32.6 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  33.64 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  30.9 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  30.74 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  30.74 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  32.39 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  31.02 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  32.42 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  30.49 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  30.84 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  33.33 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  31.9 
 
 		 242 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  30.52 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  33.18 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  29.11 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  29.39 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  28.12 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  31.13 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  31.86 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  36.27 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  32.11 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  29.44 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  28.27 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  29.58 
 
 		 220 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  30.52 
 
 		 225 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  27.65 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  28.31 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  30.66 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  27.54 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  30.77 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  28.7 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  28.77 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  26.75 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  29.26 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  30.36 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  25.76 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  26.29 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  31.25 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  31.31 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.8 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  26.79 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  29.61 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.88 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.45 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  26.82 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.36 
 
 		 165 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.25 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  23.11 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.4 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.92 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.06 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  24.4 
 
 		 350 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.21 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>