155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0723 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  100 
 
 
221 aa  462  1e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  40.65 
 
 
218 aa  178  7e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  40.37 
 
 
217 aa  174  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  29.69 
 
 
235 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  28.07 
 
 
229 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  29.07 
 
 
228 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  29.39 
 
 
235 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  29.15 
 
 
258 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  28.95 
 
 
231 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  28.38 
 
 
229 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  31.36 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  30.17 
 
 
239 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  28.19 
 
 
235 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  30.09 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  29.18 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  27.43 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  29.15 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  28.51 
 
 
221 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  28 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  27.35 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  28.97 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  29.15 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  27.35 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  27.39 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  27.52 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  28.11 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  27.11 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  27.19 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  29.76 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  28.57 
 
 
224 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  24.66 
 
 
232 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  28.7 
 
 
221 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  27.75 
 
 
242 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  28.12 
 
 
221 aa  88.2  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  28.38 
 
 
247 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  28.78 
 
 
242 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  28.78 
 
 
242 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  29.86 
 
 
223 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  29.76 
 
 
254 aa  88.2  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  31.43 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  24.89 
 
 
232 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  24.43 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  28.78 
 
 
242 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  28 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  26.7 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  29.31 
 
 
221 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  23.77 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  28.78 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  25.22 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  27.01 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  30.54 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  24.06 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  29.13 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  29.13 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  29.76 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  26.87 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  25.23 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  25.76 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  26.34 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  28.7 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  26.15 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  26.58 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  25.78 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  26.67 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  25.88 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  26.36 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  26.32 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  24.56 
 
 
235 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  23.76 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  24.43 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  25.33 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  25.54 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  22.9 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  28.57 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  26.73 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  25.11 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  25.23 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  27.15 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  25.76 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  25.11 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  26.6 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  26.36 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  26.91 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  24.09 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  25.91 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  26.7 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  25.78 
 
 
229 aa  58.5  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  26.02 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.14 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  27.6 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  25.37 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.86 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1322  nitroreductase  22.73 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  23.98 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  25.13 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  23.87 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  24.66 
 
 
200 aa  52.8  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  26.02 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  22.49 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.56 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>