237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3607 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  100 
 
 		 223 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  73.09 
 
 		 223 aa  342  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  60.81 
 
 		 221 aa  284  7e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  52.02 
 
 		 223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  52.47 
 
 		 235 aa  242  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  51.57 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  52.49 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  45.45 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  53.27 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  46.12 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  46.4 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  44.6 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  47.51 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  47.3 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  47.3 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  46.85 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  48.21 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  48.21 
 
 		 219 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  46.19 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  43.26 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  43.69 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  42.79 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  43.75 
 
 		 242 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  42.99 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  44.39 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  43.64 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  44.39 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  44.39 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  42.08 
 
 		 247 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  44.39 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  41.89 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  41.55 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  44.2 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  42.08 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  42.34 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  41.63 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  41.59 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  39.82 
 
 		 249 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  41.18 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  41.28 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  40.72 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  39.55 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  40.62 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  40.27 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  41.26 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  40.91 
 
 		 246 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  40 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  37.89 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  40 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  38.67 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  38.53 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  33.19 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  38.33 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  36.87 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  34.36 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  33.94 
 
 		 229 aa  141  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  33.18 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  33.03 
 
 		 226 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  40.19 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  40.19 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  33.18 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  34.26 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  33.33 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  35.51 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  32.59 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  34.11 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  36.24 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  33.64 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  35.21 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  31.11 
 
 		 241 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  30.22 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  32.24 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  32.41 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  32 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  29.58 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  29.58 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  32 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  30.84 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  31.48 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  26.7 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  25.43 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  25.45 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  26.34 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  26.34 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  26.99 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  26.67 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  25.45 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  20.63 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  42 
 
 		 169 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2289  nitroreductase family protein  36.71 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1083  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.93 
 
 		 269 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  26.07 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  23.89 
 
 		 184 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2042  nitroreductase  36.17 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  39.66 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  37.84 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.64 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3218  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  48.98 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.71 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3956  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  48.98 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.733345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>