120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3698 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  54.67 
 
 		 232 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  54.11 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  55.11 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  55.22 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  52.75 
 
 		 230 aa  247  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  52.65 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  57.34 
 
 		 230 aa  245  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  52.8 
 
 		 215 aa  237  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  50 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  46.88 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  44.93 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  35.62 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  33.94 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  34.65 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  38.46 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  34.67 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  34.89 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  35.55 
 
 		 236 aa  131  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  33.18 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  33.04 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  34.51 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  34.96 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  38.01 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  34.25 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  38.57 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  35.11 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  33.94 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  35.59 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  35.59 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  33.04 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  32.02 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  33.03 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  34.29 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  32.74 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  32.58 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  37.56 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  32 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  31.96 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  36.57 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  34.4 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  36.16 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  35.78 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  33.64 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  33.03 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  32.41 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  32.26 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  35.21 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  32.74 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  35.58 
 
 		 224 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  31.73 
 
 		 223 aa  118  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  31.08 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  31.88 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  33.33 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  32.71 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  30 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  33.64 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  32.29 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  30.7 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  35.87 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  34.39 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  33.63 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  34.98 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.96 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  31.92 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  31 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  33.18 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  28.04 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  30.14 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  30.32 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  28.89 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  31.88 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  31.4 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  31.08 
 
 		 225 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  32.27 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  32.27 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  30.23 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  27.71 
 
 		 270 aa  95.1  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  31.82 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  26.64 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  31.08 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  29.22 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  31.08 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  29.86 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  31.67 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  23.21 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  30.48 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  24.65 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.44 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.29 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1686  nitroreductase  22.41 
 
 		 276 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.67 
 
 		 190 aa  48.5  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.09 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  23.65 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2018  nitroreductase  23.76 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0089  hypothetical protein  61.29 
 
 		 43 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  26.32 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  25.26 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  39.13 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  21.54 
 
 		 191 aa  45.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>