222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0408 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  100 
 
 		 223 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  53.88 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  44.44 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  44.44 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  47.75 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  45.7 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  47.3 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  45.05 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  47 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  43.11 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  44 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  44.64 
 
 		 242 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  44.64 
 
 		 242 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  41.44 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  44.64 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  43.12 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  41.82 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  44.7 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  45.41 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  42.04 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  41.78 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  42.04 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  43.5 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  43.75 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  44.74 
 
 		 245 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  43.84 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  39.27 
 
 		 228 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  43.26 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  40.17 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  40.79 
 
 		 258 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  42.66 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  40.37 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  41.94 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  39.53 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  40.64 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  41.52 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  36.82 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  41.55 
 
 		 223 aa  167  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  37.9 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  40.45 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  38.39 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  36.36 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  37.39 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  39.71 
 
 		 232 aa  154  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  35.78 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  38.36 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  39.23 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  39.72 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  35.43 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  37.27 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  34.08 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  35.32 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  35.71 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  36.99 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  36.68 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  33.33 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  33.33 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  37.14 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  33.79 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  32.88 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  36.45 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  33.78 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  36.67 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  33.02 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  34.86 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  30 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  34.98 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  32.56 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  31.13 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  30.23 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  30.7 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  30.32 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  32.41 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  31.96 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  31.55 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  28.64 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  31.22 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  30 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  31.76 
 
 		 270 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28.31 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  30.14 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  29.68 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  28.77 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  25.58 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  28.83 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  29.22 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  28.24 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  27.35 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.27 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  26.26 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25.23 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.06 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  26.82 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  26.94 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.77 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  23.94 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.79 
 
 		 334 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0667  nitroreductase family protein  21.8 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>