271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3047 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  100 
 
 
239 aa  487  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  91.32 
 
 
242 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  91.32 
 
 
242 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  91.74 
 
 
242 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  89.67 
 
 
242 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  70.27 
 
 
229 aa  331  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  67.12 
 
 
231 aa  322  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  66.07 
 
 
235 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  65.62 
 
 
235 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  66.96 
 
 
235 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  67.41 
 
 
229 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  62.55 
 
 
254 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  62.93 
 
 
254 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  60.92 
 
 
246 aa  304  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  58.97 
 
 
249 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  57.78 
 
 
247 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  56.41 
 
 
242 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  57.27 
 
 
224 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  58.52 
 
 
258 aa  272  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  55.27 
 
 
257 aa  268  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  57.33 
 
 
236 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  54.31 
 
 
237 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  54.81 
 
 
239 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  57.8 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  54.82 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  54.71 
 
 
228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  49.77 
 
 
228 aa  229  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  54.19 
 
 
245 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  49.77 
 
 
231 aa  225  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  48.91 
 
 
233 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  49.09 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  50.23 
 
 
224 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  48.18 
 
 
223 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  43.5 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  44.8 
 
 
221 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  45.45 
 
 
223 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  44.44 
 
 
240 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  42.79 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  44.39 
 
 
223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  42.79 
 
 
223 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  39.09 
 
 
229 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  40.45 
 
 
226 aa  161  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  41.18 
 
 
226 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  42.47 
 
 
228 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  42.79 
 
 
232 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  40.44 
 
 
241 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  40.93 
 
 
225 aa  156  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  41.92 
 
 
232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  45.05 
 
 
221 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  43.3 
 
 
221 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  43.93 
 
 
225 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  43.05 
 
 
221 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  39.06 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  41.26 
 
 
235 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  37.05 
 
 
230 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  39.17 
 
 
215 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  36.4 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  40.36 
 
 
222 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  40.36 
 
 
222 aa  138  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  38.18 
 
 
219 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  39.91 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  33.33 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  36.16 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  37.27 
 
 
219 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  34.93 
 
 
244 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  36.48 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  38.64 
 
 
220 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  39.56 
 
 
225 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  35.85 
 
 
224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  34.93 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  35.65 
 
 
241 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  31.08 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  35.02 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  33.62 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  32.89 
 
 
225 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  32.03 
 
 
227 aa  114  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  33.05 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  31.98 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  31.39 
 
 
229 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  31.58 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  33.62 
 
 
225 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  31.16 
 
 
228 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  31.65 
 
 
217 aa  101  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  32.71 
 
 
235 aa  101  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  30.59 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  29.46 
 
 
218 aa  95.1  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  32.21 
 
 
270 aa  95.1  9e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  30.24 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  26.21 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29.85 
 
 
190 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.7 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28 
 
 
187 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.97 
 
 
334 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  27.96 
 
 
196 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  48 
 
 
165 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.11 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.26 
 
 
176 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  21.72 
 
 
185 aa  55.1  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.25 
 
 
345 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  26.47 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>