195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3999 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  73.09 
 
 		 223 aa  325  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  59.91 
 
 		 221 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  54.26 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  54.05 
 
 		 225 aa  234  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  47.98 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  49.55 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  51.13 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  54.23 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  48.65 
 
 		 221 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  45.41 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  47.51 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  47.51 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  47.06 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  44.09 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  46.67 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  43.66 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  44.84 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  43.95 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  42.33 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  43.64 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  40.99 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  39.82 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  39.91 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  40.99 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  41.18 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  42.79 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  40.54 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  41.82 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  37.9 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  41.26 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  41.89 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  40.36 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  41.89 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  38.46 
 
 		 229 aa  164  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  41.89 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  42.04 
 
 		 224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  40.37 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  39.91 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  38.33 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  39.37 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  39.82 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  37.44 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  37.67 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  35.59 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  37.78 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  39.29 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  39.29 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  37.78 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  37.16 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  37.1 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  37.1 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  34.39 
 
 		 220 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  34.8 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  34.72 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  37.44 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  32.89 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  33.03 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  33.48 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  38.1 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  37.09 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  35.64 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  32.42 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  34.72 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  33.8 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  32.86 
 
 		 244 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  30.91 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  30.45 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  30.77 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  28.7 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  29.63 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  30.91 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  30 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.78 
 
 		 218 aa  102  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  29.02 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  31.03 
 
 		 270 aa  99.4  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  30.56 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  31.63 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  28.24 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.56 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  27.11 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  26.67 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  27.39 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  27.11 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  27.93 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.78 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  25.33 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  27.03 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  42 
 
 		 169 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  23.11 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0168  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.46 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119752  normal  0.808425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  23.87 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  32.35 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  35.06 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  23.7 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3158  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40.51 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  24.75 
 
 		 347 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  22.61 
 
 		 176 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  42.86 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  46.67 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>