161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0200 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  54.05 
 
 		 223 aa  245  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  49.32 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  51.83 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  51.38 
 
 		 219 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  52.49 
 
 		 223 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  50.24 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  49.09 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  50.45 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  49.34 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  44.8 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  44.71 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  40.72 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  38.91 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  47.24 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  41.52 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  43.78 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  42.11 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  42.92 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  43.4 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  39.25 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  42.53 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  45.54 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  45.54 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  44.19 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  45.54 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  39.56 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  42.25 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  41.98 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  41.98 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  39.72 
 
 		 223 aa  159  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  39.91 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  41.15 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  41.51 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  42.79 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  39.64 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  39.64 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  38.74 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  37.73 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  40.27 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  39.19 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  41.63 
 
 		 241 aa  147  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  40.18 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  40.37 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  37.95 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  37.32 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  34.82 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  36.32 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  36.36 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  36.57 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  40.81 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  36.36 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  41.94 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  36.94 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  41.47 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  35.94 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  37.79 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  32.41 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  32.86 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  34.84 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  31.98 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  36.27 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  34.35 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  33.49 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  28.24 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  30.95 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  30.93 
 
 		 270 aa  96.3  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  29.63 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  29.25 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  29.63 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  27.36 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  26.61 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  29.41 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  30.5 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  29.41 
 
 		 234 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  31.8 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  28.97 
 
 		 232 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  26.11 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  29.46 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  28.71 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  28.57 
 
 		 241 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  28.9 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  27.8 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  29.17 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  29.85 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.57 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  24.88 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  25.53 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.33 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.04 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  26.46 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.87 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  57.78 
 
 		 174 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0821  putative NADPH nitroreductase protein  28.57 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  48.98 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  26.11 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  44.64 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.29 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  44.12 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.86 
 
 		 334 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>