150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5940 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  100 
 
 		 237 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  61.86 
 
 		 247 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  63.45 
 
 		 254 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  62.55 
 
 		 249 aa  317  7.999999999999999e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  62.61 
 
 		 254 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  60.34 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  61.43 
 
 		 242 aa  308  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  61.88 
 
 		 224 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  57.66 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  53.85 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  57.27 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  54.95 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  58.18 
 
 		 231 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  56.36 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  54.05 
 
 		 235 aa  258  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  54.31 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  54.95 
 
 		 242 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  54.5 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  54.5 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  53.1 
 
 		 257 aa  248  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  53.6 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  53.1 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  50.88 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  51.36 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  49.34 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  49.54 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  49.15 
 
 		 239 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  47.06 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  45.05 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  44.24 
 
 		 228 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  45.21 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  45 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  44.59 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  45.7 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  40.97 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  41.52 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  40.91 
 
 		 229 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  40.27 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  39.35 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  36.82 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  38.01 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  38.64 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  40.09 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  37.1 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  39.91 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  37.27 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  35.14 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  33.78 
 
 		 226 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  36.65 
 
 		 220 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  36.94 
 
 		 232 aa  134  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  35.68 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  37.21 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  33.18 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  35.32 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  34.21 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  31.98 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  30.04 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  31.58 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  34.83 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  34.25 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  37.79 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  35.86 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  34.35 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  34.35 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  34.35 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  30.73 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  30 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  32.3 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  30.18 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  34.25 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  29.31 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  32.43 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  30.73 
 
 		 217 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  27.23 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  27.54 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  26.94 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  28.51 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  27.06 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  26.27 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  27.68 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.78 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  25.23 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.01 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  26.58 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  26.09 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  24.77 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  24.11 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.55 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.05 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1846  nitroreductase  26.7 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  26.61 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.32 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1885  nitroreductase  25 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.208432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  24.87 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  41.67 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  34.18 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  46.43 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  40.62 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2852  nitroreductase  46 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>