124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0441 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  55.28 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  52.13 
 
 		 189 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  52.43 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  50 
 
 		 196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  47.12 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  46.67 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  44.5 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  42.93 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  41.67 
 
 		 192 aa  150  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  42.93 
 
 		 192 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  42.93 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  42.63 
 
 		 191 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  33.85 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.77 
 
 		 386 aa  92  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  32.34 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  27.92 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.92 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  32.39 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.34 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.55 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 163 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.99 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.45 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  32.03 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.66 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.48 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.32 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.69 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.95 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  30.61 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.4 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  26.88 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.14 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  21.24 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.19 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.48 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  26.29 
 
 		 334 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.3 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  27.89 
 
 		 278 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  20.13 
 
 		 170 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  31.06 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  31.71 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  31.1 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.88 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  27.32 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  31.01 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  29.19 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  28.68 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  28.68 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  25.77 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  42.67 
 
 		 546 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  28.78 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.88 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  30.53 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  22.63 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  31.06 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  31.06 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.68 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  23.2 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  32.43 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  22.63 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  22.63 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  22.63 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  23.2 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  23.2 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  22.63 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  32.12 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  31.52 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  30.77 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.65 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.14 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  28.4 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  27.14 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3536  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.46 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  26.06 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.13 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  41.82 
 
 		 257 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.95 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.61 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  28.57 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  28.05 
 
 		 275 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  29.08 
 
 		 275 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.16 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6394  nitroreductase  27.35 
 
 		 280 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2891  nitroreductase  27.45 
 
 		 340 aa  45.1  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.56 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0731  nitroreductase-like protein  27.5 
 
 		 347 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  24.05 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.03 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  27.27 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.82 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>