185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0863 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  100 
 
 		 224 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  84.3 
 
 		 223 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  79.37 
 
 		 223 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  78.83 
 
 		 226 aa  370  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  73.21 
 
 		 224 aa  346  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  72 
 
 		 227 aa  338  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  67.27 
 
 		 224 aa  304  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  68.45 
 
 		 205 aa  298  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  55.86 
 
 		 222 aa  252  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  54.79 
 
 		 226 aa  235  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  57.95 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  52.49 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  51.28 
 
 		 217 aa  201  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  45.33 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  46.6 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  47.47 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  47.42 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  33.15 
 
 		 184 aa  98.2  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  33.15 
 
 		 184 aa  98.2  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  31.25 
 
 		 182 aa  89.4  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.37 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.77 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.95 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.46 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  27.75 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.53 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  32.71 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.12 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.41 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  31 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.97 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.74 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.77 
 
 		 174 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  38.98 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.16 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  32.05 
 
 		 265 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  43.4 
 
 		 166 aa  52.4  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.56 
 
 		 166 aa  52.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  28.29 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  43.4 
 
 		 166 aa  52  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  42 
 
 		 270 aa  51.6  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25 
 
 		 190 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  42 
 
 		 270 aa  51.6  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  42 
 
 		 174 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  24.86 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  25.13 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  23.31 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  41.54 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  22.84 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  22.07 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0381  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.18 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.57 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  30.22 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.95 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  24.62 
 
 		 181 aa  48.9  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  41.07 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25.39 
 
 		 170 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  33.78 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  48.84 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25.17 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  48.84 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  30.56 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  48.84 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  24.86 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.28 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  35.94 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  42.59 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.88 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  34.92 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.1 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  31.25 
 
 		 345 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.66 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.8 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  26.36 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  36.11 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  31.08 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  35.82 
 
 		 174 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1532  nitroreductase  25.88 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24948  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.62 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  24.38 
 
 		 321 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.26 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  26.62 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  24.38 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  35.85 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.13 
 
 		 334 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.32 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  31.4 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.53 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.41 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  36.73 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4527  Nitroreductase-like protein  32.26 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1752  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  39.71 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  32.53 
 
 		 166 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  44.44 
 
 		 169 aa  45.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  41.18 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>