230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0762 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  100 
 
 		 223 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  83.86 
 
 		 223 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  79.37 
 
 		 224 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  77.68 
 
 		 224 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  75.34 
 
 		 226 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  74.89 
 
 		 227 aa  356  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  69.09 
 
 		 224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  70.39 
 
 		 205 aa  302  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  58.56 
 
 		 222 aa  262  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  56.88 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  59.69 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  57.22 
 
 		 230 aa  218  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  50.24 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  47.73 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  45.62 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  47.32 
 
 		 209 aa  187  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  44.29 
 
 		 239 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  34.27 
 
 		 184 aa  105  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  34.27 
 
 		 184 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  30.21 
 
 		 182 aa  88.6  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  33.09 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  34.04 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  28.85 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.57 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  28.8 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.6 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.4 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.67 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.21 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.48 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  25.5 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.11 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  50 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.84 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.5 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  31.48 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.04 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  27.32 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  44.44 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  47.17 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.06 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  35.71 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.62 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  45.28 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  47.17 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.91 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  38.46 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  26.15 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  47.73 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  47.73 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  47.73 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.83 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.27 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  40.35 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  41.18 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  33.78 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  38.6 
 
 		 174 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.06 
 
 		 170 aa  52  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.95 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.6 
 
 		 188 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  45.1 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1262  nitroreductase  36.67 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.88  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  34.48 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  47.83 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  30.12 
 
 		 166 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  29.17 
 
 		 321 aa  50.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.66 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  29.17 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  38.18 
 
 		 170 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  40.82 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  32.79 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1437  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.4 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  32.79 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  41.07 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1140  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.58 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.53 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  29.71 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  39.13 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.48 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.21 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1629  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.38 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1328  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.6 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.85 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  37.5 
 
 		 163 aa  48.9  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.99 
 
 		 334 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  28.57 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  32.79 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.77 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  44.19 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.88 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  31.67 
 
 		 345 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  24.88 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  23.46 
 
 		 167 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3715  nitroreductase  29.38 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0995943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0353  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.77 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261778  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  28.99 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.67 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  39.22 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  28.17 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>