More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2634 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  59.63 
 
 
227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  58.26 
 
 
224 aa  262  4e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  56.62 
 
 
223 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  56.22 
 
 
224 aa  259  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  56.88 
 
 
223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  54.79 
 
 
224 aa  248  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  56.59 
 
 
205 aa  247  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  53.21 
 
 
226 aa  247  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  57.8 
 
 
222 aa  245  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  55.14 
 
 
223 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  57.56 
 
 
209 aa  225  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  55.14 
 
 
223 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  55.28 
 
 
217 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  53.24 
 
 
230 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  59.09 
 
 
224 aa  207  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  50.46 
 
 
239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  36.87 
 
 
184 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  36.87 
 
 
184 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  33.16 
 
 
182 aa  97.1  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.14 
 
 
174 aa  82  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.58 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  33.33 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35.59 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  32.02 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.57 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.5 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.89 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.46 
 
 
186 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  41.79 
 
 
270 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.56 
 
 
183 aa  62  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.09 
 
 
190 aa  62  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.78 
 
 
167 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  26.55 
 
 
166 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  28.78 
 
 
179 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  40.3 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  29.35 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  28.57 
 
 
167 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.17 
 
 
169 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.27 
 
 
166 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  26.55 
 
 
166 aa  59.7  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.17 
 
 
176 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  27.69 
 
 
184 aa  58.9  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  33.02 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  24.46 
 
 
185 aa  58.9  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.33 
 
 
174 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.22 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  27.55 
 
 
181 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  27.55 
 
 
181 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.5 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  56 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  26.6 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.99 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  43.64 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  25.68 
 
 
176 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  28.9 
 
 
170 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  25.99 
 
 
167 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  28.35 
 
 
174 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  45.9 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  23.56 
 
 
345 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  28.07 
 
 
166 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25.77 
 
 
176 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.32 
 
 
173 aa  56.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  45.16 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  26.87 
 
 
215 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  25.28 
 
 
175 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.25 
 
 
178 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25.77 
 
 
171 aa  55.5  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.21 
 
 
170 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.27 
 
 
192 aa  55.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  34.46 
 
 
275 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  42.03 
 
 
233 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  44.9 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  48.39 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.18 
 
 
178 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  24.07 
 
 
176 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  49.02 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.29 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  27.42 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  32.02 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  28.26 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  26.52 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  51.92 
 
 
174 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.9 
 
 
178 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  24.56 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  49.25 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.99 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  22.03 
 
 
169 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  30.39 
 
 
169 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  45.76 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  46.67 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  26.86 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  32 
 
 
191 aa  52.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  25.99 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  29.68 
 
 
273 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  40 
 
 
204 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  24.86 
 
 
245 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  42.42 
 
 
172 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  40 
 
 
247 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.94 
 
 
215 aa  52  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>