269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3676 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  100 
 
 
205 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  72.68 
 
 
224 aa  322  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  70.39 
 
 
223 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  70.39 
 
 
223 aa  300  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  67.96 
 
 
227 aa  299  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  68.45 
 
 
226 aa  298  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  68.45 
 
 
224 aa  298  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  65.05 
 
 
224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  57.07 
 
 
222 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  56.59 
 
 
226 aa  231  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  57.07 
 
 
224 aa  221  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  56.84 
 
 
230 aa  218  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  52.91 
 
 
217 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  48.77 
 
 
223 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  49.75 
 
 
209 aa  201  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  49.47 
 
 
223 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  46.08 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  36.84 
 
 
184 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  36.84 
 
 
184 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  33.17 
 
 
182 aa  102  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.34 
 
 
186 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  26.34 
 
 
181 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  28.08 
 
 
178 aa  61.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.65 
 
 
186 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  26.13 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  32.73 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  25.6 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  42.37 
 
 
165 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.12 
 
 
171 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.92 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  27.8 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.84 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.27 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  40.62 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  24.74 
 
 
212 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  24.52 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.27 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25.91 
 
 
166 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  40.54 
 
 
173 aa  55.1  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  24.26 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  37.7 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  22.34 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  36.21 
 
 
270 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.84 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  41.27 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  41.54 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1328  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.82 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  34.92 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  25.99 
 
 
189 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  25.87 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  25.87 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  24.24 
 
 
363 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  38.6 
 
 
166 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  23.48 
 
 
265 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0743  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  40 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  21.89 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.87 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.41 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  25.99 
 
 
191 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  46 
 
 
174 aa  52  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  38.6 
 
 
166 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  39.22 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  23.46 
 
 
178 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  38.89 
 
 
221 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.04 
 
 
199 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  25.34 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  37.31 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  34.48 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.9 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25.81 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  46.51 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  38.6 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  41.67 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0782  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.93 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  25.88 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  23.64 
 
 
227 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  42.22 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.36 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  38.18 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.81 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  37.93 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  36.84 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  40 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  39.62 
 
 
170 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  23.56 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  40.98 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  36.36 
 
 
180 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  22.68 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  23.73 
 
 
321 aa  48.5  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  34.33 
 
 
170 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  36.76 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  23.43 
 
 
207 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  44.19 
 
 
221 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  26.83 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  31.82 
 
 
241 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.73 
 
 
252 aa  48.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  36 
 
 
174 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  23.73 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  31.87 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>