More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1916 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  100 
 
 		 223 aa  460  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  70 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  55.14 
 
 		 226 aa  203  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  48.29 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  52 
 
 		 217 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  47.51 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  47.73 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  52.68 
 
 		 223 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  46.08 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  51.98 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  49.47 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  47.47 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  46.98 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  53.85 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  46.82 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  53.01 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  51.58 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  33.33 
 
 		 184 aa  96.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  33.33 
 
 		 184 aa  96.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  29.94 
 
 		 182 aa  89  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.12 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.16 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  30.64 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.57 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.18 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  31.09 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.65 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  45.59 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.33 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  28.81 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4962  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.33 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  45.16 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4448  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.85 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.178194 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.62 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  28.77 
 
 		 448 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0271  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.61 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.02 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  28.95 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  44.83 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.1 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  44.83 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  47.69 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  49.06 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.46 
 
 		 471 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  42.11 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.78 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  35.82 
 
 		 321 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  44.83 
 
 		 167 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2982  nitroreductase-like protein  26.09 
 
 		 363 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.78 
 
 		 455 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  23.96 
 
 		 321 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.78 
 
 		 455 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  37.5 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  39.66 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  49.02 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  22.68 
 
 		 345 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  49.06 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  43.1 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  44.44 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  40.68 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  25.89 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  25.38 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.98 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  40.68 
 
 		 177 aa  53.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.34 
 
 		 176 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.13 
 
 		 584 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2047  putative nitroreductase  48.89 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01399e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  23.7 
 
 		 167 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  41.38 
 
 		 270 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.85 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  46.55 
 
 		 167 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  40 
 
 		 180 aa  52.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  45.1 
 
 		 169 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  54.17 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  43.33 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  30.46 
 
 		 450 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  23.76 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1978  nitroreductase family protein  31.08 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.163759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1872  nitroreductase  41.94 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  28.86 
 
 		 350 aa  52  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  36.67 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3407  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.05 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2878  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  24.88 
 
 		 279 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.348827  normal  0.405788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  28 
 
 		 458 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  38.1 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  22.8 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  43.75 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  28.95 
 
 		 446 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  33.04 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  28.02 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0141  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.84 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  30.16 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  32.47 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  29.05 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1736  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  37.68 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.321705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  48.89 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  44 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  47.17 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  35.48 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>