181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0549 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  64.02 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  60.73 
 
 		 192 aa  250  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  62.83 
 
 		 197 aa  248  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  60.53 
 
 		 192 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  53.76 
 
 		 189 aa  205  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  51.87 
 
 		 191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  45.45 
 
 		 193 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  45.41 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  44.44 
 
 		 197 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  46.6 
 
 		 191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  44.5 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  38.1 
 
 		 192 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  36.13 
 
 		 191 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.85 
 
 		 386 aa  94.7  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  29.53 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  27.61 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.88 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  19.68 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  19.25 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  19.79 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  19.68 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  19.79 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  24.84 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.5 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.56 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  21.39 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  21.39 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  27.22 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  29.27 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  25.84 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  29.01 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.16 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.75 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.16 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.56 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  22.03 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  26.75 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  26.04 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  23.93 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  28.3 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  27.01 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  28.12 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  22.03 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2827  nitroreductase  20.32 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.374853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  26.04 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  23.63 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.82 
 
 		 278 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4320  nitroreductase  28.06 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  25.16 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1696  nitroreductase  23.2 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.451691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  29.19 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  24.86 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  28.92 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  24.44 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.17 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  22.98 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  23.04 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4023  nitroreductase  21.29 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479853  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  28.03 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.94 
 
 		 330 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  26.23 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0360  nitroreductase  23.6 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  25 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47329  predicted protein  24.19 
 
 		 261 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  23.33 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  28.75 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  26.42 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.57 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2581  nitroreductase  28 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00210488  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  22.35 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  23.08 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.47 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  23.97 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  26.22 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  27.88 
 
 		 170 aa  48.9  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  27.67 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1374  nitroreductase  23.44 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.82 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  23.9 
 
 		 167 aa  48.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  21.92 
 
 		 177 aa  48.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2149  nitroreductase  26.13 
 
 		 225 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00130487  normal  0.0184861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1646  nitroreductase  24.18 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.95 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  27.64 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  23.46 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  25.41 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  28.75 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  26.71 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  22.98 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  26.11 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  28.77 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  25.95 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.47 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  25 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  28.49 
 
 		 243 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  26.9 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  24.14 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  24.71 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  23.28 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>