130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0455 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0455  nitroreductase family protein  100 
 
 
197 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  65.45 
 
 
192 aa  264  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0549  nitroreductase  62.83 
 
 
192 aa  248  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1413  nitroreductase family protein  59.26 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  58.2 
 
 
192 aa  229  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1944  nitroreductase  52.15 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0326  nitroreductase  49.21 
 
 
191 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0375  nitroreductase  49.19 
 
 
196 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0028718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0578  nitroreductase  46.56 
 
 
193 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.431005  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1518  nitroreductase  40.21 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  hitchhiker  0.00282354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0441  nitroreductase  42.93 
 
 
217 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0956  nitroreductase  42.41 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000316504  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2259  nitroreductase  40.21 
 
 
192 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  35.52 
 
 
191 aa  116  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.45 
 
 
386 aa  98.6  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  30.49 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  26.88 
 
 
170 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  30.68 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  31.68 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  28.57 
 
 
278 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.97 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  29.03 
 
 
183 aa  58.5  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  31.14 
 
 
178 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  31.94 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  24.84 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.98 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.59 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  28.86 
 
 
169 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  25.97 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  20.11 
 
 
170 aa  55.1  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.5 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  31.87 
 
 
181 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0905  nitroreductase  21.99 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000395807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.38 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  28.95 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25.97 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.1 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  26.19 
 
 
175 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.5 
 
 
173 aa  52  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  23.76 
 
 
172 aa  52  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  32.08 
 
 
171 aa  51.6  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.92 
 
 
184 aa  51.6  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.35 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.32 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  30.25 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.51 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  25.99 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  25.99 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  25 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  21.56 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  22.89 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  27.33 
 
 
203 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2524  nitroreductase-like  25.93 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000539057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  23.6 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  26.97 
 
 
179 aa  48.5  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0106  nitroreductase  23.33 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  23.42 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  22 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1324  NAD(P)H nitroreductase, putative  25.27 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000367676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1006  nitroreductase  25.29 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269661  normal  0.607301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3075  nitroreductase family protein  21.93 
 
 
212 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.3 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  26.22 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3070  nitroreductase family protein  21.81 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.511917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0109  nitroreductase  22.78 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  21.93 
 
 
212 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  21.93 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  21.81 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  25 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1071  nitroreductase  23.66 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  21.93 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  21.93 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  24.2 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  28.03 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  23.38 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68560  putative nitroreductase  25.28 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  25.62 
 
 
168 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  24.29 
 
 
345 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3671  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.39 
 
 
213 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.77 
 
 
184 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  23.64 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  22.95 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.82 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1405  nitroreductase  25.86 
 
 
204 aa  44.7  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  24.22 
 
 
184 aa  45.1  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  27.34 
 
 
189 aa  44.7  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  27.56 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  29.86 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  28.03 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  25.47 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  25 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  23.33 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.45 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  22.09 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  23.57 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  25.57 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  25.94 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5933  putative nitroreductase  24.72 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.91 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  24.26 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>